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Fragmentación y pesada
Una vez tomadas las muestras de calizas en algún afloramiento y una vez que se han siglado, se rompe en fragmentos de entre 3 y 5 cm de diámetro aproximadamente para facilitar el ataque del ácido. Se pesa 1 Kg de fragmentos que es la cantidad estándar que se estudia en una investigación preliminar. El resto de la muestra se pesa y se guarda por si necesitáramos disolver más muestra.

Disolución
Se introduce el Kg de fragmentos en una redecilla de plástico, como la de los ajos o cebollas, y se sumerge en los 10 litros de disolución que se han preparado en un recipiente de polietileno de 12 litros de capacidad.
Por cada Kg de muestra se preparan 10 litros de disolución de ácido acético tamponada con acetado cálcico, que contienen:
7.400 ml de agua
600 ml de ácido acético glacial
2.000 ml de acetato cálcico
El recipiente puede taparse con un trocito de film envolvente para aislar la disolución y evitar, en parte, que el fuerte olor inunde el laboratorio, aunque lo ideal sería disponer de campanas extractoras.
La disolución de acetato cálcico se obtiene de disoluciones previas de calizas con ácido acético, es decir, cuando se acaba el ácido o se disuelve toda la muestra, la disolución resultante no se tira, si no que se guarda para tamponar posteriores tratamientos.
Se usa ácido acético porque los elementos conodontales son de fosfato cálcico y resisten el ataque de los ácidos, mientras que la roca de carbonato cálcico sí se disuelve.

La muestra se deja aproximadamente una semana, hasta que todo el ácido se ha gastado. Esto podemos comprobarlo observando si al agitar la redecilla dentro del cubo no burbujea o comprobando con papel indicador universal que el pH es superior a 5.
Cuando el ácido se agota pero queda muestra sin disolver se retira la disolución, pero no toda, si no que se deja la cantidad proporcional, de acetato cálcico, a la cantidad que quede de muestra y se añade el agua y ácido acético glacial necesarios para completar la disolución.

Lavado y tamizado
Tanto si se acaba la muestra como si se agota el ácido, se toma el residuo sólido que queda en el fondo del recipiente y se tamiza. Se utiliza un juego de dos tamices de 0.5 y 0.16 mm de luz de malla. Los elementos conodontales quedan retenidos en el tamiz inferior, junto con todas las partículas de la roca con tamaños comprendidos entre ambos tamices.

Secado
Ese residuo que queda en el tamiz se recoge en cápsulas de porcelana y se seca en una estufa o al aire. Cuando esté seco se guardará en botecitos, como los de los carretes de fotos, para su posterior estudio.

Lavado de los tamices
Es muy importante lavar bien los tamices, ya que puede producirse contaminación por otras muestras procesadas. Se introducen los tamices entre lavado y lavado en azul de metileno, unos dos minutos aproximadamente, para tintar todas las partículas en general y los conodontos en concreto. Si encontramos una partícula o un fósil teñida de azul, sabremos en seguida que procede de otra muestra.

Después se limpian cuidadosamente con un pincel o una brocha de pelo fino, para eliminar las posibles partículas o conodontos que hayan quedado atrapados entre los alambres del tamiz.

Triado bajo la lupa binocular
Ese residuo seco se esparce en pequeñas cantidades sobre una bandejilla o batea de aproximandamente 10×6cm con el fondo blanco y dividido en pequeñas cuadrículas de 1 cm de lado. El examen debe ser muy minucioso y se irá examinando cuadrícula por cuadrícula. Con un pincel muy fino, el más fino que haya en la papelería, y humedecido se van extrayendo los elementos conodontales que se encuentren. Hay que tener mucha paciencia, y puede ser que no aparezca ninguno.

Es interesante ir anotando lo que se vaya observando en la muestra, como la presencia de restos micáceos o cristalitos de pirita. Puede que posteriormente se le encuentre significado.

Almacenamiento
Los elementos conodontales hallados se introducen en unas celdillas donde están perfectamente protegidos y donde se examinan detalladamente para su clasificación, que será el último paso. Puede ponerse plastilina de color claro, ya que los elementos conodontales son generalemnte negros o de tonos oscuros, para facilitar su observación en cualquier posición.